Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BgnP28653 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BgnP28653 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BgnP28653 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BgnP28653 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BgnP28653 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BgnP28653 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BgnP28653 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BgnP28653 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BgnP28653 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BgnP28653 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
BgnP28653 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BgnP28653 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
BgnP28653 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
BgnP28653 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
BgnP28653 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
BgnP28653 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BgnP28653 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BgnP28653 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BgnP28653 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BgnP28653 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BgnP28653 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BgnP28653 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BgnP28653 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BgnP28653 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BgnP28653 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BgnP28653 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
BgnP28653 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
BgnP28653 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms