Protein–RNA interactions for Protein: P28652

Camk2b, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camk2bP28652 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Camk2bP28652 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms