Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxd9P28357 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hoxd9P28357 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms