Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gjb3P28231 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Gjb3P28231 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms