Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2afxP27661 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2afxP27661 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
H2afxP27661 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2afxP27661 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms