Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cd40lgP27548 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd40lgP27548 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms