Protein–RNA interactions for Protein: P26618

Pdgfra, Platelet-derived growth factor receptor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfraP26618 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
PdgfraP26618 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms