Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChgaP26339 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChgaP26339 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ChgaP26339 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ChgaP26339 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChgaP26339 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChgaP26339 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChgaP26339 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChgaP26339 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChgaP26339 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChgaP26339 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChgaP26339 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ChgaP26339 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChgaP26339 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChgaP26339 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ChgaP26339 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ChgaP26339 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ChgaP26339 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChgaP26339 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChgaP26339 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChgaP26339 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChgaP26339 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ChgaP26339 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ChgaP26339 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChgaP26339 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChgaP26339 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChgaP26339 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChgaP26339 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChgaP26339 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC21.31■■□□□ 1
ChgaP26339 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChgaP26339 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChgaP26339 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChgaP26339 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChgaP26339 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ChgaP26339 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ChgaP26339 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ChgaP26339 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChgaP26339 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChgaP26339 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChgaP26339 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ChgaP26339 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChgaP26339 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ChgaP26339 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChgaP26339 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ChgaP26339 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ChgaP26339 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ChgaP26339 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC21.29■■□□□ 1
ChgaP26339 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ChgaP26339 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ChgaP26339 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ChgaP26339 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ChgaP26339 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChgaP26339 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChgaP26339 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChgaP26339 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ChgaP26339 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChgaP26339 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChgaP26339 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ChgaP26339 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ChgaP26339 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ChgaP26339 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ChgaP26339 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms