Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
NdnP25233 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
NdnP25233 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NdnP25233 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NdnP25233 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NdnP25233 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NdnP25233 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NdnP25233 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NdnP25233 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NdnP25233 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NdnP25233 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NdnP25233 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NdnP25233 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
NdnP25233 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NdnP25233 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NdnP25233 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NdnP25233 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NdnP25233 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NdnP25233 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
NdnP25233 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
NdnP25233 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
NdnP25233 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NdnP25233 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
NdnP25233 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NdnP25233 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
NdnP25233 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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