Protein–RNA interactions for Protein: P24549

Aldh1a1, Retinal dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aldh1a1P24549 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Aldh1a1P24549 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Aldh1a1P24549 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms