Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tsta3P23591 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tsta3P23591 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms