Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hoxd8P23463 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hoxd8P23463 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms