Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3aP23116 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3aP23116 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3aP23116 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3aP23116 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3aP23116 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3aP23116 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3aP23116 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3aP23116 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3aP23116 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Eif3aP23116 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3aP23116 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3aP23116 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3aP23116 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3aP23116 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3aP23116 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3aP23116 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3aP23116 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Eif3aP23116 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Eif3aP23116 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Eif3aP23116 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Eif3aP23116 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Eif3aP23116 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Eif3aP23116 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3aP23116 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3aP23116 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3aP23116 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3aP23116 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3aP23116 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3aP23116 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3aP23116 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3aP23116 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Eif3aP23116 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3aP23116 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3aP23116 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3aP23116 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3aP23116 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3aP23116 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3aP23116 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3aP23116 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3aP23116 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3aP23116 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3aP23116 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3aP23116 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3aP23116 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3aP23116 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Eif3aP23116 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3aP23116 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3aP23116 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Eif3aP23116 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Eif3aP23116 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3aP23116 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3aP23116 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3aP23116 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3aP23116 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Eif3aP23116 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3aP23116 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Eif3aP23116 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Eif3aP23116 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3aP23116 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Eif3aP23116 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3aP23116 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3aP23116 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3aP23116 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3aP23116 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3aP23116 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3aP23116 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Eif3aP23116 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3aP23116 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3aP23116 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Eif3aP23116 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3aP23116 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3aP23116 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3aP23116 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3aP23116 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3aP23116 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3aP23116 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3aP23116 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3aP23116 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3aP23116 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Eif3aP23116 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms