Protein–RNA interactions for Protein: P22518

Clk1, Dual specificity protein kinase CLK1, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk1P22518 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk1P22518 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk1P22518 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Clk1P22518 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk1P22518 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk1P22518 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Clk1P22518 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms