Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpcP21841 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpcP21841 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SftpcP21841 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SftpcP21841 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms