Protein–RNA interactions for Protein: P21237

Bdnf, Brain-derived neurotrophic factor, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BdnfP21237 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BdnfP21237 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BdnfP21237 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
BdnfP21237 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
BdnfP21237 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms