Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnnc2P20801 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnnc2P20801 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms