Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
PrkcaP20444 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PrkcaP20444 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms