Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cox5bP19536 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms