Protein–RNA interactions for Protein: P19182

Ifrd1, Interferon-related developmental regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd1P19182 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ifrd1P19182 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ifrd1P19182 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms