Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rps6ka1P18653 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rps6ka1P18653 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms