Protein–RNA interactions for Protein: P18526

Ig heavy chain V region 345, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18526 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P18526 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18526 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18526 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18526 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18526 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18526 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18526 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18526 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18526 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P18526 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18526 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18526 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18526 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18526 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18526 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18526 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18526 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18526 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P18526 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P18526 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18526 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18526 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18526 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18526 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18526 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18526 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18526 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18526 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P18526 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P18526 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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