Protein–RNA interactions for Protein: P15375

Myf6, Myogenic factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myf6P15375 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myf6P15375 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myf6P15375 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Myf6P15375 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myf6P15375 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Myf6P15375 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 243.2 ms