Protein–RNA interactions for Protein: P12813

Nr4a1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr4a1P12813 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Nr4a1P12813 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Nr4a1P12813 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms