Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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DmdP11531 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DmdP11531 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DmdP11531 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DmdP11531 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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DmdP11531 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DmdP11531 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DmdP11531 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
DmdP11531 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DmdP11531 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DmdP11531 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DmdP11531 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
DmdP11531 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
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DmdP11531 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
DmdP11531 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
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DmdP11531 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
DmdP11531 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DmdP11531 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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DmdP11531 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
DmdP11531 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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DmdP11531 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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DmdP11531 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
DmdP11531 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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DmdP11531 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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DmdP11531 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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DmdP11531 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DmdP11531 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DmdP11531 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DmdP11531 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DmdP11531 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DmdP11531 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DmdP11531 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DmdP11531 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DmdP11531 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DmdP11531 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DmdP11531 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DmdP11531 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DmdP11531 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DmdP11531 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DmdP11531 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DmdP11531 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms