Protein–RNA interactions for Protein: P0DPB4

Schip1, Schwannomin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Schip1P0DPB4 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Schip1P0DPB4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Schip1P0DPB4 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms