Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Dnmt3cP0DOY1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Dnmt3cP0DOY1 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms