Protein–RNA interactions for Protein: P09079

Hoxb5, Homeobox protein Hox-B5, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb5P09079 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Hoxb5P09079 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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