Protein–RNA interactions for Protein: P09055

Itgb1, Integrin beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb1P09055 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Itgb1P09055 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Itgb1P09055 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms