Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hoxd3P09027 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd3P09027 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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