Protein–RNA interactions for Protein: P09024

Hoxb7, Homeobox protein Hox-B7, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb7P09024 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hoxb7P09024 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hoxb7P09024 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms