Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Hoxa5P09021 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxa5P09021 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Hoxa5P09021 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa5P09021 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa5P09021 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa5P09021 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa5P09021 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Hoxa5P09021 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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