Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Spta1P08032 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spta1P08032 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Spta1P08032 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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