Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Prm2P07978 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
Prm2P07978 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Prm2P07978 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Prm2P07978 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.3□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 AC123738.2-201ENSMUST00000223791 1899 ntBASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Prm2P07978 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.29□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms