Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06321 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06321 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06321 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06321 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06321 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06321 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06321 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06321 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P06321 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06321 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P06321 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06321 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06321 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06321 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06321 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06321 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P06321 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06321 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06321 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06321 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06321 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06321 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06321 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P06321 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06321 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
P06321 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06321 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
P06321 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P06321 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
P06321 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
P06321 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06321 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06321 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06321 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06321 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06321 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06321 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06321 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06321 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06321 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06321 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06321 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06321 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06321 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06321 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
P06321 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
P06321 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
P06321 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms