Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
ItgamP05555 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ItgamP05555 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms