Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
H2-Eb1P04230 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms