Protein–RNA interactions for Protein: P04104

Krt1, Keratin, type II cytoskeletal 1, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt1P04104 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Krt1P04104 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt1P04104 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt1P04104 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt1P04104 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Krt1P04104 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms