Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01678 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01678 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01678 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01678 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01678 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01678 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01678 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01678 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01678 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01678 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01678 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01678 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
P01678 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01678 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01678 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01678 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01678 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
P01678 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01678 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01678 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01678 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01678 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01678 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01678 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01678 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01678 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01678 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01678 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01678 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01678 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01678 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01678 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01678 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01678 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01678 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01678 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01678 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01678 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01678 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01678 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01678 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01678 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01678 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01678 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01678 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01678 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01678 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01678 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01678 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01678 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01678 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms