Protein–RNA interactions for Protein: P01653

Ig kappa chain V-V region W3082, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01653 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
P01653 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01653 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01653 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01653 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01653 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01653 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01653 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01653 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
P01653 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01653 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01653 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01653 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01653 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01653 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01653 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01653 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01653 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01653 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
P01653 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01653 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01653 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01653 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01653 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01653 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01653 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01653 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01653 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01653 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01653 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
P01653 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01653 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01653 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01653 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01653 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01653 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01653 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
P01653 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
P01653 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01653 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01653 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
P01653 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01653 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01653 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01653 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01653 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01653 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01653 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01653 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01653 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01653 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01653 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01653 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01653 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01653 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01653 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
P01653 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01653 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01653 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
P01653 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01653 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01653 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01653 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
P01653 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
P01653 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01653 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01653 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01653 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01653 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01653 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
P01653 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01653 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01653 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01653 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01653 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01653 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01653 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01653 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01653 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01653 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01653 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01653 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01653 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01653 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01653 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01653 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
P01653 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
P01653 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms