Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl20O89093 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl20O89093 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl20O89093 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl20O89093 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl20O89093 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl20O89093 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl20O89093 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl20O89093 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl20O89093 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl20O89093 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl20O89093 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl20O89093 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl20O89093 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl20O89093 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl20O89093 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl20O89093 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl20O89093 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl20O89093 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl20O89093 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl20O89093 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl20O89093 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl20O89093 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl20O89093 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl20O89093 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl20O89093 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl20O89093 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl20O89093 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl20O89093 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl20O89093 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl20O89093 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl20O89093 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl20O89093 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl20O89093 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl20O89093 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl20O89093 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl20O89093 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl20O89093 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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Ccl20O89093 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl20O89093 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl20O89093 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl20O89093 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl20O89093 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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Ccl20O89093 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl20O89093 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl20O89093 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl20O89093 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl20O89093 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ccl20O89093 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
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Ccl20O89093 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Ccl20O89093 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Ccl20O89093 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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Ccl20O89093 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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Ccl20O89093 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl20O89093 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl20O89093 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl20O89093 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl20O89093 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl20O89093 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl20O89093 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl20O89093 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl20O89093 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl20O89093 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl20O89093 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl20O89093 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl20O89093 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl20O89093 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl20O89093 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl20O89093 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Ccl20O89093 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Ccl20O89093 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl20O89093 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl20O89093 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl20O89093 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl20O89093 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl20O89093 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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