Protein–RNA interactions for Protein: O88627

Slc28a2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a2O88627 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Slc28a2O88627 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms