Protein–RNA interactions for Protein: O88533

Ddc, Aromatic-L-amino-acid decarboxylase, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DdcO88533 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DdcO88533 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DdcO88533 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DdcO88533 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DdcO88533 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DdcO88533 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DdcO88533 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DdcO88533 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DdcO88533 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DdcO88533 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DdcO88533 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DdcO88533 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DdcO88533 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DdcO88533 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DdcO88533 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DdcO88533 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DdcO88533 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DdcO88533 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DdcO88533 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DdcO88533 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DdcO88533 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DdcO88533 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DdcO88533 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DdcO88533 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DdcO88533 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DdcO88533 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DdcO88533 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DdcO88533 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DdcO88533 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DdcO88533 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DdcO88533 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
DdcO88533 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DdcO88533 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DdcO88533 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DdcO88533 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DdcO88533 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DdcO88533 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DdcO88533 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DdcO88533 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DdcO88533 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DdcO88533 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DdcO88533 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DdcO88533 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DdcO88533 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DdcO88533 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DdcO88533 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DdcO88533 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DdcO88533 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DdcO88533 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DdcO88533 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DdcO88533 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DdcO88533 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DdcO88533 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms