Protein–RNA interactions for Protein: O88430

Ccl22, C-C motif chemokine 22, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl22O88430 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ccl22O88430 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccl22O88430 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms