Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cfdp1O88271 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cfdp1O88271 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cfdp1O88271 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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