Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd46O88174 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd46O88174 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Cd46O88174 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms