Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Kdm6aO70546 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms