Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Vamp4O70480 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms