Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Chrna4O70174 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrna4O70174 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms