Protein–RNA interactions for Protein: O55237

Cd70, CD70 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd70O55237 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd70O55237 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd70O55237 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd70O55237 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd70O55237 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd70O55237 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd70O55237 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cd70O55237 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms